RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP1A4	Q13733	1029 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC9A5	Q14940	896 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	NAA25	Q14CX7	972 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNJ9	Q92806	393 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	INPP5D	Q92835	1189 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	PKP4	Q99569	1192 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC30A3	Q99726	388 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	CUTC	Q9NTM9	273 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	DHRS7	Q9Y394	339 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0J9YVX5	310 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PPV9	198 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	HYKK	A2RU49	373 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	TTLL8	A6PVC2	850 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF839	A8K0R7	811 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	MYO1C	O00159	1063 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	DSCR3	O14972	297 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	CTSV	O60911	334 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ONECUT2	O95948	504 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	MPC1L	P0DKB6	136 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	PGAM1	P18669	254 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	MCM3	P25205	808 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC1A2	P43004	574 aa		9	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	PNLIPRP1	P54315	467 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	MLLT10	P55197	1068 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	PTK6	Q13882	451 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNMB4	Q86W47	210 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ASB11	Q8WXH4	323 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SMPDL3A	Q92484	453 aa		9	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	DPH7	Q9BTV6	452 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR83	Q9NYM4	423 aa		9	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		8.99	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	FITM1	A5D6W6	292 aa		8.99	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	GFY	I3L273	518 aa		8.99	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	KLHL41	O60662	606 aa		8.99	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	8.99	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	TTC4	O95801	387 aa		8.99	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	UMOD	P07911	640 aa		8.99	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ERVK-10	P10266	1014 aa		8.99	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	ERG	P11308	486 aa		8.99	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	8.99	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	OR1D4	P47884	311 aa		8.99	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXL2	P58012	376 aa		8.99	□□□□□ -0.97

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