RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 CHST8Q9H2A9 424 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SMYD2Q9NRG4 433 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 NINJ2Q9NZG7 142 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 BTRCQ9Y297 605 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SLC5A10A0PJK1 596 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 FAM159BA6NKW6 160 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 MATN2O00339 956 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 MYBL2P10244 700 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 NDUFS1P28331 727 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 GABRB3P28472 473 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 FMO4P31512 558 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CCR7P32248 378 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 STX2P32856 288 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PRKAA1Q13131 559 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 GPS2Q13227 327 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CNSTQ6PJW8 725 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PHC3Q8NDX5 983 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PPM1MQ96MI6 270 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 HGH1Q9BTY7 390 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 MAP10Q9P2G4 905 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 TCFL5Q9UL49 500 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 MED16Q9Y2X0 877 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PSAT1Q9Y617 370 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 HAUS5O94927 633 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 AOAHP28039 575 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CD151P48509 253 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 BRD3Q15059 726 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 TMED2Q15363 201 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CYS1Q717R9 158 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 DSELQ8IZU8 1212 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 LCN9Q8WX39 176 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 KCNJ9Q92806 393 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 GPR83Q9NYM4 423 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CDYLQ9Y232 598 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 COMMD10Q9Y6G5 202 aa16.04■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 KLHL41O60662 606 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PIAS1O75925 651 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 AHSGP02765 367 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 APOA4P06727 396 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 MSL3P1P0C860 447 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PRKG2Q13237 762 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 GBX1Q14549 363 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 KYNUQ16719 465 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 PRR7Q8TB68 274 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 FBF1Q8TES7 1133 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CDKL2Q92772 493 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 IP6K3Q96PC2 410 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 NDNQ99608 321 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 MCMBPQ9BTE3 642 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 C5AR2Q9P296 337 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 CENPEQ02224 2701 aa16.03■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 A1L4Q6 167 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 GSAPA4D1B5 854 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 A6NL46 340 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK9-211ENST00000557673 E5RI56 91 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms