RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CNST	Q6PJW8	725 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MED25	Q71SY5	747 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NDC1	Q9BTX1	674 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ING2	Q9H160	280 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	LRRK2	Q5S007	2527 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137		A0A1B0GX78	115 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	OR2A25	A4D2G3	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ZNF839	A8K0R7	811 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137		K7EM74	188 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CTSV	O60911	334 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	HAUS5	O94927	633 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	EMP3	P54852	163 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	RRAD	P55042	308 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SOX8	P57073	446 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	GNG11	P61952	73 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NFKB2	Q00653	900 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	GRM7	Q14831	915 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MSS51	Q4VC12	460 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	RNF44	Q7L0R7	432 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	RAB43	Q86YS6	212 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CD200R1	Q8TD46	325 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PTER	Q96BW5	349 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	WDR54	Q9H977	334 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137		E7ENX8	843 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	DSCR3	O14972	297 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TP73	O15350	636 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SLC16A8	O95907	504 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IGHE	P01854	428 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ITGAX	P20702	1163 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	GABRB3	P28472	473 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CMPK1	P30085	196 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ABAT	P80404	500 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	DR1	Q01658	176 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TAP2	Q03519	686 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	KCNC4	Q03721	635 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TLE1	Q04724	770 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	STEAP4	Q687X5	459 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	HPS6	Q86YV9	775 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FAM136A	Q96C01	138 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PKP4	Q99569	1192 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	GPR21	Q99679	349 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		11	□□□□□ -0.65

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