RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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PTPRB-209ENST00000550857 OR6C74A6NCV1 312 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-209ENST00000550857 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-209ENST00000550857 TPP1O14773 563 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-209ENST00000550857 FFAR3O14843 346 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-209ENST00000550857 GPR42O15529 346 aa7.85□□□□□ -1.15
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