RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PEPDP12955 493 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 GSTT1P30711 240 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 GRIA2P42262 883 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 NOVP48745 357 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 MCFD2Q8NI22 146 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 RNF19AQ9NV58 838 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRB-208ENST00000550358 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 HYKKA2RU49 373 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF879B4DU55 563 aa8.29□□□□□ -1.08
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