RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PDE7BQ9NP56 450 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 FGF21Q9NSA1 209 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 TAC3Q9UHF0 121 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 RARRES3Q9UL19 164 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 BSNQ9UPA5 3926 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 A0A087WV48 116 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 STMND1H3BQB6 276 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SLC16A5O15375 505 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 RAD1O60671 282 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 STK17BO94768 372 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 CCDC166P0CW27 439 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 STMN1P16949 149 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 GCAP28676 217 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 TNFRSF8P28908 595 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 GRIA3P42263 894 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 RAB10P61026 200 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 VSNL1P62760 191 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 TUBB4BP68371 445 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ACY1Q03154 408 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 CSHL1Q14406 222 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 RAPH1Q70E73 1250 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SMPDL3AQ92484 453 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PTERQ96BW5 349 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PYCR2Q96C36 320 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 MED8Q96G25 268 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SPRY4Q9C004 299 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PARVBQ9HBI1 364 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SNX15Q9NRS6 342 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ARL15Q9NXU5 204 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ATMQ13315 3056 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ITPR1Q14643 2758 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PCSK5Q92824 1860 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 MGAQ8IWI9 3026 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ZNF839A8K0R7 811 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 H3BMH7 237 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 CTSVO60911 334 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 SCRG1O75711 98 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 NTRK1P04629 796 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 INHBAP08476 426 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ABHD2P08910 425 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 CD1DP15813 335 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 CD82P27701 267 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 CSRP3P50461 194 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 TLE3Q04726 772 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 NAE1Q13564 534 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 IL11RAQ14626 422 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 OR4D1Q15615 310 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
CS-211ENST00000548041 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.28□□□□□ -1.08
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