RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 OR52A5Q9H2C5 316 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 EBF2Q9HAK2 575 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SLC22A14Q9Y267 594 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 NUMA1Q14980 2115 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 VPS4BO75351 444 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ULK1O75385 1050 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 PROS1P07225 676 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 HNF4AP41235 474 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 MED27Q6P2C8 311 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM207Q6UWW9 146 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SPATA21Q7Z572 469 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF547Q8IVP9 402 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 EPN3Q9H201 632 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 FANCEQ9HB96 536 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 NPHS2Q9NP85 383 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 OR6C2Q9NZP2 312 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 KLHL3Q9UH77 587 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 TAC3Q9UHF0 121 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 MIA3Q5JRA6 1907 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 URADA6NGE7 173 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 DLL1O00548 723 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 RGS14O43566 566 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 EPN2O95208 641 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SLC16A8O95907 504 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 WNT1P04628 370 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 GRK6P43250 576 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 MAZP56270 477 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SKP1P63208 163 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 KIR2DS3Q14952 304 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC6Q16204 474 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF678Q5SXM1 525 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 CYHR1Q6ZMK1 362 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM26Q6ZUK4 368 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 MINDY1Q8N5J2 469 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ARL10Q8N8L6 244 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ZBTB44Q8NCP5 570 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 CDC26Q8NHZ8 85 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SLC5A11Q8WWX8 675 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 RHBDF1Q96CC6 855 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ATOH8Q96SQ7 321 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SIKE1Q9BRV8 207 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 KNL1Q8NG31 2342 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 A0A088AWK7 358 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 A0A1B0GTQ1 180 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 GFYI3L273 518 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SLC28A1O00337 649 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 MATN4O95460 622 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ENGP17813 658 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 GDF5P43026 501 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 RXRGP48443 463 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 MXRA7P84157 204 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 OCRLQ01968 901 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 RGS1Q08116 209 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 BNIP3Q12983 259 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRO-210ENST00000544244 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 ARL14Q8N4G2 192 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 PDPRQ8NCN5 879 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 COL26A1Q96A83 441 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRO-210ENST00000544244 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
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