RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518059.5

UBXN8-204, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-204ENST00000518059 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 TMEM74Q96NL1 305 aa7.23□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.23□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 BDH2Q9BUT1 245 aa7.23□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 ACTL8Q9H568 366 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 H0YIV9 168 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 APODP05090 189 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 LINGO3P0C6S8 592 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 NCK1P16333 377 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 PCDH1Q08174 1060 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 LAPTM5Q13571 262 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 PGS1Q32NB8 556 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 UBE2E3Q969T4 207 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 PHOX2BQ99453 314 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBXN8-204ENST00000518059 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 HDAC8Q9BY41 377 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 OR2AG1Q9H205 316 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 BRF2Q9HAW0 419 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 SGK2Q9HBY8 427 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
UBXN8-204ENST00000518059 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.22□□□□□ -1.25
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