RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DARSP14868 501 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NMBRP28336 390 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSK3BP49841 420 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACY1Q03154 408 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAF10Q12962 218 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR68Q15743 365 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCNG2Q16589 344 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPOQ8IVL8 374 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM114A1Q8IWE2 563 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDK20Q8IZL9 346 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNTROBQ8N137 903 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM149B1Q96BN6 582 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAD9AQ99638 391 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIP5K1AQ99755 562 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MXD3Q9BW11 206 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DEFB126Q9BYW3 111 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLSCR3Q9NRY6 295 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DAPK2Q9UIK4 370 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNMA2Q9UL42 364 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARID2Q68CP9 1835 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FER1L5A0AVI2 2057 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPL37AP8A6NKH3 93 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR3A2P47893 321 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NDST2P52849 883 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXT1Q16394 746 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BAK1Q16611 211 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC35D3Q5M8T2 416 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANO1Q5XXA6 986 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IRGCQ6NXR0 463 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COMMD2Q86X83 199 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AVL9Q8NBF6 648 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC37A3Q8NCC5 494 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPEPL1Q8NDH3 523 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR11H4Q8NGC9 324 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NFKBIDQ8NI38 313 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBX15Q96SF7 602 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PANK2Q9BZ23 570 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRCC1Q9C099 1032 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ITM2CQ9NQX7 267 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHCGQ9UBD6 479 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB26Q9ULW5 256 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STUB1Q9UNE7 303 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNURFLB1AK76 121 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDHXO00330 501 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VILLO15195 856 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACTN1P12814 892 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPS2P15880 293 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SELEP16581 610 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FASP25445 335 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MEOX2P50222 304 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERVPABLB-1P60509 514 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERVK-16P61578 105 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OLR1P78380 273 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP2R2BQ00005 443 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GALNT2Q10471 571 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MELKQ14680 651 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM132DQ14C87 1099 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTPN14Q15678 1187 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LTB4RQ15722 352 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UPP1Q16831 310 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ODF4Q2M2E3 257 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CFAP206Q8IYR0 622 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF525Q8N782 197 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STARD4Q96DR4 205 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERLEC1Q96DZ1 483 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBXN10Q96LJ8 280 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C16orf70Q9BSU1 422 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MIS12Q9H081 205 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RIC8AQ9NPQ8 531 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CUTCQ9NTM9 273 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AMACRQ9UHK6 382 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM17Q9Y577 477 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.26
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1B0GTH9 108 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNFSF11O14788 317 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SURF4O15260 269 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEC14L2O76054 403 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 F9P00740 461 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD5P06127 495 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ODC1P11926 461 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPX3P22352 226 aa0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms