RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516697.1

RNU6-180P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 180, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-180P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-180P-201ENST00000516697 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GABRA5P31644 462 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NUDT1P36639 197 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PNPLA4P41247 253 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 BRCC3P46736 316 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TM4SF4P48230 202 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRIM2P49643 509 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRELPP51888 382 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC25A1P53007 311 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRKAA2P54646 552 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 DIO3P55073 304 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MTTPP55157 894 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PEX3P56589 373 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRTAP12-1P59990 96 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ERVPABLB-1P60509 514 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CACNG7P62955 275 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 AP2B1P63010 937 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM193AP78312 1265 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRT85P78386 507 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CXCL6P80162 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PAX2Q02962 417 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TAF10Q12962 218 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRKG2Q13237 762 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MFAP5Q13361 173 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 UNC119Q13432 240 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TNK1Q13470 666 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CUL4BQ13620 913 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GGTLC2Q14390 218 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GRM3Q14832 879 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IL17AQ16552 155 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF74Q16587 644 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TAF9Q16594 264 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MEP1AQ16819 746 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 VWC2Q2TAL6 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GRAMD1BQ3KR37 738 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF667Q5HYK9 610 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MDH1BQ5I0G3 518 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CBWD5Q5RIA9 395 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LINC00242Q5T6M2 205 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRR9Q5T870 116 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM102BQ5T8I3 360 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 AGAP6Q5VW22 663 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OTPQ5XKR4 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CYB5R2Q6BCY4 276 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OR52W1Q6IF63 320 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SULT6B1Q6IMI4 303 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GALNT17Q6IS24 598 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LIN54Q6MZP7 749 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NOTUMQ6P988 496 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC22A25Q6T423 547 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF600Q6ZNG1 722 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PQLC2Q6ZP29 291 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 Q6ZSA8 131 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 Q75L30 129 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZER1Q7Z7L7 766 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 COMMD2Q86X83 199 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF677Q86XU0 584 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FMNL3Q8IVF7 1028 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CEP97Q8IW35 865 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 HSCBQ8IWL3 235 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MTURNQ8N3F0 131 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FBXW8Q8N3Y1 598 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MARVELD2Q8N4S9 558 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MYCT1Q8N699 235 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF525Q8N782 197 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PLD5Q8N7P1 536 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 L3MBTL4Q8NA19 623 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ATG16L2Q8NAA4 619 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RNF149Q8NC42 400 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OR7A2PQ8NGA2 310 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OR11H4Q8NGC9 324 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OR13C3Q8NGS6 347 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OR13J1Q8NGT2 312 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF671Q8TAW3 534 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FBXO30Q8TB52 745 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TBC1D16Q8TBP0 767 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM71BQ8TC56 605 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC22A8Q8TCC7 542 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms