RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TGM2P21980 687 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PDX1P52945 283 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ELOCQ15369 112 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 MYLK3Q32MK0 819 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 FAM153CQ494X1 144 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC14Q49A88 953 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GUSBP11Q6P575 273 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SRLQ86TD4 932 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 LMX1AQ8TE12 382 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM159Q96B96 161 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 GANQ9H2C0 597 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SATB2Q9UPW6 733 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 D6RAR5 112 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 J3QKU1 62 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KLK10O43240 276 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TMCC1O94876 653 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PRB1P04280 392 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ANXA6P08133 673 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KRT3P12035 628 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DESP17661 470 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CCKBRP32239 447 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 MMP12P39900 470 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CSNK1DP48730 415 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DNA2P51530 1060 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PGDP52209 483 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TPTEP56180 551 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 HDAC4P56524 1084 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PPARDQ03181 441 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PMS2P11Q13670 270 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NFATC4Q14934 902 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CAMK4Q16566 473 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CDKN3Q16667 212 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TAF3Q5VWG9 929 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 NAA35Q5VZE5 725 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ERAP2Q6P179 960 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 EMC1Q8N766 993 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 MED8Q96G25 268 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SGCZQ96LD1 299 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 STRADBQ9C0K7 418 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 ITM2BQ9Y287 266 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 LRP4O75096 1905 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 CPED1A4D0V7 1026 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-222ENST00000514552 FAM72CH0Y354 149 aa6.74□□□□□ -1.33
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