RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490895.5

IMP4-216, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene IMP4, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-216ENST00000490895 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 IGHEP01854 428 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 ERGP11308 486 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 MCM3P25205 808 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 FOXL2P58012 376 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 GRM7Q14831 915 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 DCAF10Q5QP82 559 aa14.7□□□□□ -0.06
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IMP4-216ENST00000490895 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 COG1Q8WTW3 980 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.7□□□□□ -0.06
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IMP4-216ENST00000490895 MYO1CO00159 1063 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 PEX12O00623 359 aa14.69□□□□□ -0.06
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IMP4-216ENST00000490895 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
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IMP4-216ENST00000490895 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 ATCAYQ86WG3 371 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 NACC2Q96BF6 587 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 WDR54Q9H977 334 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 MED16Q9Y2X0 877 aa14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 OR2A25A4D2G3 310 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 E5RI56 91 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 NRP2O60462 931 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 PHF2O75151 1096 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 FNTAP49354 379 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 CTBP1Q13363 440 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 MYBPC3Q14896 1274 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 NAA25Q14CX7 972 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 COX15Q7KZN9 410 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 RNF44Q7L0R7 432 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 SLC35F6Q8N357 371 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 SMPDL3AQ92484 453 aa14.68□□□□□ -0.06
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IMP4-216ENST00000490895 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 SLC30A3Q99726 388 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.68□□□□□ -0.06
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IMP4-216ENST00000490895 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.67□□□□□ -0.06
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IMP4-216ENST00000490895 KIF5CO60282 957 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 CATP04040 527 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 MMP11P24347 488 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 CMPK1P30085 196 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 SOX8P57073 446 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 RAPSNQ13702 412 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 NKG7Q16617 165 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 LONRF1Q17RB8 773 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.67□□□□□ -0.06
IMP4-216ENST00000490895 SLC6A19Q695T7 634 aa14.67□□□□□ -0.06
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