RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, human

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL20-204	ENST00000489160	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	IL10	P22301	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	NME5	P56597	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ASIC1	P78348	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PTGES	O14684	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	WDPCP	O95876	746 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RLN1	P04808	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TYMP	P19971	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MSH3	P20585	1137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ASCL1	P50553	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CX3CL1	P78423	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FUT11	Q495W5	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	EXT2	Q93063	718 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	DHX58	Q96C10	678 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ACE	P12821	1306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160		E9PI62	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CLDN4	O14493	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CLIC2	O15247	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CRYAA	P02489	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	UROS	P10746	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FGF5	P12034	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MARK3	P27448	753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CDC25C	P30307	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PRPH	P41219	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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