RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 SDK2Q58EX2 2172 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A087X0M5 115 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1B0GX30 115 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PIPSLA2A3N6 862 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 USP1O94782 785 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT3P12035 628 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NFKBIAP25963 317 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MST1P26927 711 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPR1P46091 355 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 HDAC4P56524 1084 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 AP2B1P63010 937 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDK3Q00526 305 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NR1D2Q14995 579 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 BBS12Q6ZW61 710 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 DPPA4Q7L190 304 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARCQ7LC44 396 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 STRADAQ7RTN6 431 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCAMP4Q969E2 229 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 COG8Q96MW5 612 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR2M4Q96R27 311 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SIX2Q9NPC8 291 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 DONSONQ9NYP3 566 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 AASSQ9UDR5 926 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TLK1Q9UKI8 766 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CREBBPQ92793 2442 aa6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 E9PLN8 166 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 H0Y3Z8 333 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 DFFAO00273 331 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNPH1O43598 174 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRAMEF11O60813 436 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEMA7AO75326 666 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 INMTO95050 263 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 DESP17661 470 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 GM2AP17900 193 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPD1P21695 349 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 F8A1P23610 371 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CASP14P31944 242 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTPN9P43378 593 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RGRP47804 291 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CSNK1DP48730 415 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 WNT3P56703 355 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TPI1P60174 286 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MXRA7P84157 204 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 HHEXQ03014 270 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF529Q6P280 563 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 BMPERQ8N8U9 685 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 RSC1A1Q92681 617 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NTAN1Q96AB6 310 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 COQ10AQ96MF6 247 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TEX101Q9BY14 249 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD84Q9UIB8 345 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCND3Q9UK17 655 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 DAPP1Q9UN19 280 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 NEU3Q9UQ49 428 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRK2Q5S007 2527 aa6.96□□□□□ -1.29
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PPH5 198 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR2W5A6NFC9 320 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 M0QYG6 137 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYO1CO00159 1063 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCP110O43303 1012 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP7B1O75881 506 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIAA0754O94854 1291 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 HAUS5O94927 633 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms