RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485274.1

GPATCH2-204, Transcript of G-patch domain containing 2, human

TSL 3

Gene GPATCH2, Length 343 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH2-204	ENST00000485274	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	DCC	P43146	1447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CPD	O75976	1380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274		E7EWF7	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	OR10H2	O60403	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	TBX10	O75333	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	YEATS4	O95619	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	PFKFB1	P16118	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	MC5R	P33032	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	FMO5	P49326	533 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	USP16	Q9Y5T5	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274		A0A0B4J293	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274		A0A1W2PPM1	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	BUB3	O43684	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CTSV	O60911	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	TADA2A	O75478	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	GGPS1	O95749	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	DANCR	P0C864	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	AMD1	P17707	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	PSMC4	P43686	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	RAD23A	P54725	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	TPM4	P67936	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCZ1B	P86790	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	MFAP5	Q13361	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	CD101	Q93033	1021 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPATCH2-204	ENST00000485274	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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