RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483485.5

SNX5-211, Transcript of sorting nexin 5, humanhuman

TSL 2

Gene SNX5, Length 3,087 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5-211ENST00000483485 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.36□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SLC22A1O15245 554 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 FFAR2O15552 330 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 MOSPD3O75425 235 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SELLP14151 372 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 RGS4P49798 205 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SLC7A2P52569 658 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 APOFQ13790 326 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.239e-88■■■■□ 25.7
SNX5-211ENST00000483485 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 GPR33Q49SQ1 333 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 VPS26BQ4G0F5 336 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 LRRC66Q68CR7 880 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 MACC1Q6ZN28 852 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 TPRG1Q6ZUI0 275 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 TERB1Q8NA31 727 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 OR2T11Q8NH01 316 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ROPN1LQ96C74 230 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SCRN2Q96FV2 425 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 MOGAT1Q96PD6 335 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 MAP10Q9P2G4 905 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 INSL6Q9Y581 213 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 IRAK3Q9Y616 596 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 CACNG2Q9Y698 323 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 A0A1W2PRQ8 180 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 OR5K3A6NET4 321 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SHOXO15266 292 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 GRM6O15303 877 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 RAD51BO15315 384 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 UGT2B4P06133 528 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 LHCGRP22888 699 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 DGKAP23743 735 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 NUBP1P53384 320 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 EPHA5P54756 1037 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 COPZ1P61923 177 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ADGRE1Q14246 886 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 USP45Q70EL2 814 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 UTS2BQ765I0 119 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 LILRA2Q8N149 483 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ZBTB2Q8N680 514 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 PDPRQ8NCN5 879 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 LRCH3Q96II8 777 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 NELL2Q99435 816 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 APOL5Q9BWW9 433 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 BBS2Q9BXC9 721 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 AIG1Q9NVV5 245 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 AGAP14A8MT82 685 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 ANGPT2O15123 496 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 PEX1O43933 1283 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 INMTO95050 263 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 GUCA1CO95843 209 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 FGBP02675 491 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 FAPQ12884 760 aa7.34□□□□□ -1.23
SNX5-211ENST00000483485 GTF2H2Q13888 395 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms