RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MND1Q9BWT6 205 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB26Q9HCK0 441 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZIM2Q9NZV7 527 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PRB8 838 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C5orf51A6NDU8 294 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DGKQP52824 942 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEP1AQ16819 746 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO43Q4G163 708 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CENPSQ8N2Z9 138 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCG2Q9UNQ0 655 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUDT6P53370 316 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRISP3P54108 245 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TUBA1BP68363 451 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TUBA1AQ71U36 451 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF516Q92618 1163 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLIC1O00299 241 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GATBO75879 557 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSS51Q4VC12 460 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF627Q7L945 461 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL21EPA6NDL7 271 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 INMTO95050 263 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC35A5Q9BS91 424 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRP6O75581 1613 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OPN1SWP03999 348 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLA-DQB2P05538 268 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JAG1P78504 1218 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CES5AQ6NT32 575 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHL35Q6PF15 583 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IQCHQ86VS3 1027 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GMLQ99445 158 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF38Q9H0F5 515 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MKLN1Q9UL63 735 aa16.77■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0G2JPF8 293 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFHP08603 1231 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNAZP19086 355 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRPS1L1P21108 318 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRK6P43250 576 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLA2G16P53816 162 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHDQ02161 417 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIPR1Q53HC9 387 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BIRC7Q96CA5 298 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ISPDA4D126 451 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NIPSNAP2O75323 286 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF806P0C7X5 589 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UFM1P61960 85 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDKL1Q00532 357 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFA9Q16795 377 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBXN11Q5T124 520 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MBLAC2Q68D91 279 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMED9Q9BVK6 235 aa16.77■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMU1Q2TAY7 513 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARMC5Q96C12 935 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HPF1Q9NWY4 346 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C9IYK1 514 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 I3L521 148 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VIPP01282 170 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD72P21854 359 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GJA9P57773 515 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4F3Q6IEY1 312 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF773Q6PK81 442 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COX18Q8N8Q8 333 aa16.76■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SETD6Q8TBK2 473 aa16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms