RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472556.5

LRRC27-208, Transcript of leucine rich repeat containing 27, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LRRC27, Length 646 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27-208ENST00000472556 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 CST8O60676 142 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 WISP2O76076 250 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 TMEM253P0C7T8 217 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 RPA4Q13156 261 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 MFAP5Q13361 173 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 CUL1Q13616 776 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 TLDC1Q6P9B6 456 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SNX20Q7Z614 316 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 PIANPQ8IYJ0 282 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 RASGEF1CQ8N431 466 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 DTWD1Q8N5C7 304 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 LRRC57Q8N9N7 239 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 OR11G2Q8NGC1 345 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 PSMF1Q92530 271 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 FKBP10Q96AY3 582 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 NDC1Q9BTX1 674 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 LHPPQ9H008 270 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 C10orf88Q9H8K7 445 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 CHST11Q9NPF2 352 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 OLAHQ9NV23 265 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 EURLQ9NYK6 297 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 CTSFQ9UBX1 484 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 CRLS1Q9UJA2 301 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 NUP210LQ5VU65 1888 aa9□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 A0A1B0GX78 115 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 C2orf81A6NN90 581 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 MED26O95402 600 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ALBP02768 609 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 RALBP11234 206 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 CAPN3P20807 821 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ALAS2P22557 587 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SHMT2P34897 504 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SOX11P35716 441 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 GYS2P54840 703 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 KRTAP10-9P60411 292 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 TCEAL1Q15170 157 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 KAZNQ674X7 775 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 FCRL6Q6DN72 434 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 AMER2Q8N7J2 671 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 BCORP1Q8N888 145 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 NR4A3Q92570 626 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ULK4Q96C45 1275 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 HAUS1Q96CS2 278 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 CCDC120Q96HB5 630 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 LMF1Q96S06 567 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 VAT1Q99536 393 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 MENTQ9BUN1 341 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 GBA3Q9H227 469 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 WDR54Q9H977 334 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ITGALP20701 1170 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 MAGP20916 626 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 ACRV1P26436 265 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 MST1P26927 711 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 HTR1EP28566 365 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 RBL1P28749 1068 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 MC4RP32245 332 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 EMP3P54852 163 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRC27-208ENST00000472556 GEMP55040 296 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms