RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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SMKR1-201ENST00000462322 TARM1B6A8C7 271 aa23.03■■□□□ 1.28
SMKR1-201ENST00000462322 E7ESA3 106 aa23.03■■□□□ 1.28
SMKR1-201ENST00000462322 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB14O43829 449 aa23.03■■□□□ 1.28
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SMKR1-201ENST00000462322 RGS4P49798 205 aa23.03■■□□□ 1.28
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SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP19Q14CB8 494 aa23.03■■□□□ 1.28
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SMKR1-201ENST00000462322 FAM117AQ9C073 453 aa23.03■■□□□ 1.28
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SMKR1-201ENST00000462322 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
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SMKR1-201ENST00000462322 RHBDD2Q6NTF9 364 aa23.02■■□□□ 1.28
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SMKR1-201ENST00000462322 GBP5Q96PP8 586 aa23■■□□□ 1.27
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SMKR1-201ENST00000462322 HECTD2Q5U5R9 776 aa22.99■■□□□ 1.27
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SMKR1-201ENST00000462322 C17orf62Q9BQA9 187 aa22.99■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
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SMKR1-201ENST00000462322 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.99■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.99■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.99■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 TAC3Q9UHF0 121 aa22.99■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 TCFL5Q9UL49 500 aa22.99■■□□□ 1.27
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