RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GAREM1Q9H706 876 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 DCTN4Q9UJW0 460 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 USH1CQ9Y6N9 552 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GPR179Q6PRD1 2367 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 MATN2O00339 956 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 CCND1P24385 295 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SHMT2P34897 504 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 UGT3A2Q3SY77 523 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 MILR1Q7Z6M3 343 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 AMIGO1Q86WK6 493 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 NEIL2Q969S2 332 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 MIPEPQ99797 713 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 STK38LQ9Y2H1 464 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 RNF11Q9Y3C5 154 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa23.44■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 E7EQ34 232 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP33O14559 1287 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GIPC1O14908 333 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 AZIN1O14977 448 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 JUNP05412 331 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PSMB5P28074 263 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 FASLGP48023 281 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PLCL1Q15111 1095 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 KANK2Q63ZY3 851 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 LCTLQ6UWM7 567 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GATAD2AQ86YP4 633 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 CLYBLQ8N0X4 340 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 CDYL2Q8N8U2 506 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GPR156Q8NFN8 814 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 OR2I1PQ8NGU4 316 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SAP25Q8TEE9 199 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 ACAT2Q9BWD1 397 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 OR6C2Q9NZP2 312 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 TIMM22Q9Y584 194 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 KCNE2Q9Y6J6 123 aa23.43■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PPM1DO15297 605 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 DFNA5O60443 496 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 EBLN1P0CF75 366 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SERPINB3P29508 390 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 YBX1P67809 324 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 IL27RAQ6UWB1 636 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 TMEM26Q6ZUK4 368 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SH3KBP1Q96B97 665 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SRMSQ9H3Y6 488 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 ACTR8Q9H981 624 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SPHK1Q9NYA1 384 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 TAC3Q9UHF0 121 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 RAB23Q9ULC3 237 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa23.42■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 A0A0G2JND7 137 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 HDAC3O15379 428 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 WFS1O76024 890 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 CLDN9O95484 217 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GNAZP19086 355 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 AQP5P55064 265 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PCDH1Q08174 1060 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 CHIT1Q13231 466 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 KYQ8NBH2 561 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 C10orf82Q8WW14 230 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 TWSG1Q9GZX9 223 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 BTN3A3O00478 584 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 CAPN1P07384 714 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 CD22P20273 847 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 HK2P52789 917 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 TCF15Q12870 199 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 L3MBTL4Q8NA19 623 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 OR2A1Q8NGT9 310 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 HAUS8Q9BT25 410 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 VTI1BQ9UEU0 232 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 DYRK1BQ9Y463 629 aa23.41■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa23.4■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SLCO1B7G3V0H7 640 aa23.4■■□□□ 1.34
NME4-209ENST00000460297 SYPP08247 313 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms