RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758		H3BM21	787 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CXCR6	O00574	342 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RFXANK	O14593	260 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GNGT2	O14610	69 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NPC1	O15118	1278 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	EPN2	O95208	641 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ARSA	P15289	507 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	AMD1	P17707	334 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PEX19	P40855	299 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GDF5	P43026	501 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GSTM5	P46439	218 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RAD23A	P54725	363 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MTAP	Q13126	283 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	XKR6	Q5GH73	641 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	LIPI	Q6XZB0	460 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR149	Q86SP6	731 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SYT12	Q8IV01	421 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DTD2	Q96FN9	168 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF583	Q96ND8	569 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	C3orf18	Q9UK00	162 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GMEB1	Q9Y692	573 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	C7orf72	A4D263	438 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HIDE1	A8MVS5	230 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SOCS2	O14508	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJB5	O75953	348 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HRH2	P25021	359 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ITGB8	P26012	769 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GRIA2	P42262	883 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4D2	P58180	307 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DAG1	Q14118	895 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	E2F2	Q14209	437 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PTGR1	Q14914	329 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TEAD4	Q15561	434 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SGO1	Q5FBB7	561 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MED27	Q6P2C8	311 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758		Q6ZVL8	140 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NCLN	Q969V3	563 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NUS1	Q96E22	293 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MTERF3	Q96E29	417 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR34	Q96EX3	536 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGED4	Q96JG8	741 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	COQ10A	Q96MF6	247 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM74	Q96NL1	305 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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