RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 S1PR4O95977 384 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 CD9P21926 228 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 KIR3DL1P43629 444 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 MAGED4Q96JG8 741 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 IL17FQ96PD4 163 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRA-208ENST00000455631 PRAMEF2O60811 474 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 MBD3O95983 291 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 CXCR2P25025 360 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 TPM4P67936 248 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 TLE4Q04727 773 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ITIH4Q14624 930 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 MENTQ9BUN1 341 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 OR5H15A6NDH6 313 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 CTSVO60911 334 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 OR56A5P0C7T3 313 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 MYBL2P10244 700 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 FBLP22087 321 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 CCDC181Q5TID7 509 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 PACS1Q6VY07 963 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 LRRC45Q96CN5 670 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 RNF32Q9H0A6 362 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 WISP2O76076 250 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 RPN2P04844 631 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 EMP2P54851 167 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ABHD17BQ5VST6 288 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 OR2L8Q8NGY9 312 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 MCCC2Q9HCC0 563 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 A0A0J9YVX5 310 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 OR51F1A6NGY5 319 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 IDSB3KWA1 339 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 FFAR3O14843 346 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 GPR42O15529 346 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 APOC2P02655 101 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ITGAMP11215 1152 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 TPH1P17752 444 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 POU6F1Q14863 301 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 BBS12Q6ZW61 710 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 A0A1W2PQ72 361 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 FAM227AF5H4B4 570 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 MARCKSL1P49006 195 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF33BQ06732 778 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 GRB7Q14451 532 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 LONRF1Q17RB8 773 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 MUM1Q2TAK8 710 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 LUZP1Q86V48 1076 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 VRK3Q8IV63 474 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 STYXQ8WUJ0 223 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 SPATA13Q96N96 652 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 SPOCK3Q9BQ16 436 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 MEMO1Q9Y316 297 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRA-208ENST00000455631 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.1■■□□□ 1.13
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