RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.56■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ABCB7O75027 752 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CTSAP10619 480 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 JUPP14923 745 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PCSK2P16519 638 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 IL7RP16871 459 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MATN1P21941 496 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PRKACGP22612 351 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CA8P35219 290 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MAGEA2P43356 314 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 BROXQ5VW32 411 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 OR4F3Q6IEY1 312 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CYP2U1Q7Z449 544 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 EID3Q8N140 333 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SGCDQ92629 289 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CORO1BQ9BR76 489 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PPW3 197 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PQ67 120 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 WASH3PC4AMC7 463 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SEC14L2O76054 403 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 C1QCP02747 245 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CD22P20273 847 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CREMQ03060 361 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CHIT1Q13231 466 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FANCEQ9HB96 536 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM9Q9P0T7 183 aa15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 RFXANKO14593 260 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 KPNA5O15131 536 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SCN2BO60939 215 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 HALP42357 657 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 VAC14Q08AM6 782 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MEP1AQ16819 746 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FGD3Q5JSP0 725 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 DOK6Q6PKX4 331 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ADNPQ9H2P0 1102 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 LTBP2Q14767 1821 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0J9YVX5 310 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF30P17039 623 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PFKLP17858 780 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 KIR3DL1P43629 444 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ENTPD1P49961 510 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ISL1P61371 349 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CD47Q08722 323 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SERPINA11Q86U17 422 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ADIPOR2Q86V24 386 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FRS2Q8WU20 508 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 MYLIPQ8WY64 445 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ELMO1Q92556 727 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FBXL8Q96CD0 374 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FAM83DQ9H4H8 585 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PREBQ9HCU5 417 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 VNN3Q9NY84 501 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 C3orf18Q9UK00 162 aa15.54■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FGF18O76093 207 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SLCO2B1O94956 709 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 HTR1AP08908 422 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PRPS1L1P21108 318 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 PPM1AP35813 382 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 WNT3P56703 355 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 UGT8Q16880 541 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SPARTQ8N0X7 666 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 SNX19Q92543 992 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 EBPLQ9BY08 206 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 RNF208Q9H0X6 261 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 ASAH2Q9NR71 780 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.53■□□□□ 0.08
SHQ1-202ENST00000444040 CARNS1A5YM72 827 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms