RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMX1AQ8TE12 382 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 NXPE2Q96DL1 559 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF747Q9BV97 191 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC61Q9BV99 259 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC17A9Q9BYT1 436 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC39A8Q9C0K1 460 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC19Q9H756 370 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPCSQ9HAB8 311 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASS4Q9NQ75 786 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO6Q9UM54 1294 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 KALRNO60229 2985 aa4.41□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPED1A4D0V7 1026 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGPSO00116 658 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF4O00268 1085 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 AQP9O43315 295 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEC1O60732 1142 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAMEF11O60813 436 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TM7SF2O76062 418 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELFN1P0C7U0 828 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALPPL2P10696 532 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTPS1P17812 591 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 EGR1P18146 543 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINA4P29622 427 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PBX1P40424 430 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RABIFP47224 123 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 AIF1P55008 147 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH6P55285 790 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS2R40P59535 323 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBED6P86452 979 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAD51Q06609 339 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC10A7Q0GE19 358 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAF2Q12933 501 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RALGDSQ12967 914 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGCGQ13326 291 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 FHL3Q13643 280 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNIQ14094 377 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYTH1Q15438 398 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYLK3Q32MK0 819 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC122Q5T0U0 273 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC9A4Q6AI14 798 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOK6Q6PKX4 331 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MACC1Q6ZN28 852 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAVSQ7Z434 540 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM74Q86UV6 250 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DTX2Q86UW9 622 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCHQ86VS3 1027 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PELI3Q8N2H9 469 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A45Q8N413 288 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND6BQ8NEG7 585 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4C6Q8NH72 309 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MUL1Q969V5 352 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 VOPP1Q96AW1 172 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMFQ96LC9 184 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOLD1Q96LR9 279 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSMCE3Q96MG7 304 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM14Q96QK8 99 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHAC1Q9H158 963 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPY26PQ9H489 355 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLPH3Q9H4A6 298 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5MQ9NPB1 228 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 AIPL1Q9NZN9 384 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MOSPD1Q9UJG1 213 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HYOU1Q9Y4L1 999 aa4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms