RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PLCL2Q9UPR0 1127 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa24.05■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ATXN8OSP0DMR3 200 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ERGP11308 486 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 RHDQ02161 417 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP19Q14CB8 494 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SYTL1Q8IYJ3 562 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 OR2L3Q8NG85 312 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CDKL2Q92772 493 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC45A3Q96JT2 553 aa24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 LOC400499M0QZD8 3231 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PRKAR1AP10644 381 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 HSD17B2P37059 387 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MCOLN3Q8TDD5 553 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SEC14L1Q92503 715 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZUFSPQ96AP4 578 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 RUFY1Q96T51 708 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 EURLQ9NYK6 297 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE10AQ9Y233 779 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SEC16AO15027 2179 aa24.03■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF839A8K0R7 811 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MEN1O00255 615 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FKBP9O95302 570 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPAN12O95859 305 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 C8GP07360 202 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 GSTA2P09210 222 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CMPK1P30085 196 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TAS2R39P59534 338 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 DNASE1L3Q13609 305 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF460Q14592 562 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 LCN10Q6JVE6 187 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 C16orf46Q6P387 395 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM207Q6UWW9 146 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CTAGE3PQ8IX95 158 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 IFT81Q8WYA0 676 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 STARD8Q92502 1023 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS39Q96JC1 886 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PHACTR1Q9C0D0 580 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CHST8Q9H2A9 424 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 RHOJQ9H4E5 214 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PARVBQ9HBI1 364 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TXNDC16Q9P2K2 825 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TAC3Q9UHF0 121 aa24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1-202ENST00000425695 E7ENX8 843 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 NRP2O60462 931 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 TAP2Q03519 686 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PTCHD3Q3KNS1 767 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 DSELQ8IZU8 1212 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC9Q92623 222 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 EXTL1Q92935 676 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 DPH7Q9BTV6 452 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PCMTD2Q9NV79 361 aa24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM159BA6NKW6 160 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 TARM1B6A8C7 271 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 H3BMH7 237 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 TERTO14746 1132 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC16A5O15375 505 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CTSVO60911 334 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 IMPA1P29218 277 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PHKG1Q16816 387 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf189Q5VU69 101 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PCSK4Q6UW60 755 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CYS1Q717R9 158 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP97Q8IW35 865 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PPM1NQ8N819 430 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 FBF1Q8TES7 1133 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC138Q96M89 665 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC6A20Q9NP91 592 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 STARD5Q9NSY2 213 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 KCND3Q9UK17 655 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa24■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A0J9YVX5 310 aa23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVH48-1M5A8F1 160 aa23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms