RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 AREL1O15033 823 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 AP2A2O94973 939 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CXCL14O95715 111 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CYP2A7P20853 494 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 TRPC1P48995 793 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 UBE3AQ05086 875 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 SGO1Q5FBB7 561 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 ENPP6Q6UWR7 440 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 ZNF555Q8NEP9 628 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 NUDT8Q8WV74 236 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 MAGED4Q96JG8 741 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 FAM118AQ9NWS6 357 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A13Q9UJS0 675 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 IRAK3Q9Y616 596 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa23.14■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 WASH3PC4AMC7 463 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PER2O15055 1255 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 DNAJB5O75953 348 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 LHCGRP22888 699 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 EMP3P54852 163 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 TMBIM6P55061 237 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 C21orf58P58505 322 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 DCDC1P59894 354 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CYP4F8P98187 520 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 MTAPQ13126 283 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 HIPK1Q86Z02 1210 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 FBXO30Q8TB52 745 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 NRBF2Q96F24 287 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 ING2Q9H160 280 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 RAD18Q9NS91 495 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC11Q9NVH1 559 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 BLOC1S6Q9UL45 172 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 LEFTY2O00292 366 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PRKD3O94806 890 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 TCF3P15923 654 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PTPN6P29350 595 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PHC1P78364 1004 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PCDH1Q08174 1060 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 DMC1Q14565 340 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 NKG7Q16617 165 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 LIPJQ5W064 366 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 OR13F1Q8NGS4 319 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 MCOLN3Q8TDD5 553 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 TOR3AQ9H497 397 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 OCEL1Q9H607 264 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 BRD9Q9H8M2 597 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PLGRKTQ9HBL7 147 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 EBF1Q9UH73 591 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 C3orf18Q9UK00 162 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 C5orf42Q9H799 3197 aa23.13■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 QSOX1O00391 747 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 ABCB7O75027 752 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 C1SP09871 688 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PRPS1L1P21108 318 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 MAGEA2P43356 314 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PLCL1Q15111 1095 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 SERPINA11Q86U17 422 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 FAM86B1Q8N7N1 296 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PYURFQ96I23 114 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa23.12■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CFAP99D6REC4 459 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 SEC14L2O76054 403 aa23.11■■□□□ 1.29
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PMS1-205ENST00000409985 CRHBPP24387 322 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PLIN5Q00G26 463 aa23.11■■□□□ 1.29
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PMS1-205ENST00000409985 GCNT7Q6ZNI0 430 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 FBXL8Q96CD0 374 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 MAPRE3Q9UPY8 281 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 H3BMQ9 156 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 GNGT2O14610 69 aa23.11■■□□□ 1.29
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PMS1-205ENST00000409985 PCNAP12004 261 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 JUPP14923 745 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 AMD1P17707 334 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 SDC1P18827 310 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 GSTM2P28161 218 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 HLA-FP30511 346 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 CTBSQ01459 385 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 PTCHD3Q3KNS1 767 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 FRG2Q64ET8 278 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 FAM81AQ8TBF8 368 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 STARD8Q92502 1023 aa23.11■■□□□ 1.29
PMS1-205ENST00000409985 COG8Q96MW5 612 aa23.11■■□□□ 1.29
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