RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CYP4X1Q8N118 509 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 OR6C1Q96RD1 312 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CTRCQ99895 268 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PDE7BQ9NP56 450 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 BTRCQ9Y297 605 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SDK2Q58EX2 2172 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 GFYI3L273 518 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 CD1DP15813 335 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 SH3BP2P78314 561 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 IRF9Q00978 393 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 TLE3Q04726 772 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 CLN3Q13286 438 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 KLC3Q6P597 504 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 D2HGDHQ8N465 521 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 FANCEQ9HB96 536 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 APMAPQ9HDC9 416 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.07■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 KLHL2O95198 593 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 TPBGLP0DKB5 382 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 COL6A2P12110 1019 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 UGT2B7P16662 529 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 ATP1A2P50993 1020 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 NRTNQ99748 197 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 CENPHQ9H3R5 247 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 PARVBQ9HBI1 364 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 RARRES3Q9UL19 164 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa20.06■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 A0A1W2PPM1 405 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 ISM1B1AKI9 464 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 CDC7O00311 574 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 MYZAPP0CAP1 466 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 EBLN1P0CF75 366 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 PYGBP11216 843 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 FGF5P12034 268 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 HIST1H2ADP20671 130 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 ITPKBP27987 946 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 GMPRP36959 345 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 TMPRSS3P57727 454 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 DLG1Q12959 904 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 GRB7Q14451 532 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 KCNAB1Q14722 419 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 NXNL1Q96CM4 212 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 PPM1MQ96MI6 270 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 MENTQ9BUN1 341 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 FGF21Q9NSA1 209 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 WDR70Q9NW82 654 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.05■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 A0A0J9YY10 115 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC189A1A4V9 331 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 GOLGA8RI6L899 631 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 MYO1CO00159 1063 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 STK17BO94768 372 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 FOLR1P15328 257 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 ST6GAL1P15907 406 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 TFEBP19484 476 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 TRABD2AQ86V40 505 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 LCA5Q86VQ0 697 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 DTX1Q86Y01 620 aa20.04■□□□□ 0.8
C4orf48-201ENST00000409248 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms