RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 PLOD3O60568 738 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 PRAMEF12O95522 483 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 CHRNA1P02708 482 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 AOC1P19801 751 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 NOVP48745 357 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 FZD4Q9ULV1 537 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 C9P02748 559 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 IRF7Q92985 503 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 GPER1Q99527 375 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TAC3Q9UHF0 121 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TCHHQ07283 1943 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 SYN1P17600 705 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 ENGP17813 658 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 BCAP31P51572 246 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 PGDP52209 483 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 OLIG2Q13516 323 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 NXPE1Q8N323 547 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 NEK7Q8TDX7 302 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 FAR1Q8WVX9 515 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF31Q96EP0 1072 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 COL21A1Q96P44 957 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 PSKH2Q96QS6 385 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 GSDMCQ9BYG8 508 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TAF4O00268 1085 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 ARPC2O15144 300 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 CLCN7P51798 805 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 OR4F3Q6IEY1 312 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 POF1BQ8WVV4 589 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 COPS4Q9BT78 406 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 ABI3Q9P2A4 366 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF222Q9UK12 451 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM233B4DJY2 109 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 COCHO43405 550 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF220Q5VTB9 566 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 USP30Q70CQ3 517 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TRPV1Q8NER1 839 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TVP23BQ9NYZ1 205 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 LRP6O75581 1613 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 EI24O14681 340 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAJB13P59910 316 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIB2Q92519 343 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 C1orf21Q9H246 121 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 ING3Q9NXR8 418 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 DHRS7Q9Y394 339 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 KLK1P06870 262 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 CCKBRP32239 447 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 IRF5Q13568 498 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 GPR153Q6NV75 609 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 IFT27Q9BW83 186 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1W2PP18 115 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 H6PDO95479 791 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 HMGN1P05114 100 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 MERTKQ12866 999 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TGFBIQ15582 683 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms