RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 CES5AQ6NT32 575 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 NLRC3Q7RTR2 1065 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ZIC5Q96T25 663 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ACBD6Q9BR61 282 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 DSN1Q9H410 356 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 DUOX1Q9NRD9 1551 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 MEIOCA2RUB1 952 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 EFCAB14O75071 495 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 VPS4BO75351 444 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CYP17A1P05093 508 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 SMIM6P0DI80 62 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 MLNP12872 115 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PAICSP22234 425 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 DRG2P55039 364 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CASP9P55211 416 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ZNF283Q8N7M2 679 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 NDNFQ8TB73 568 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 TTC9Q92623 222 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 LGMNQ99538 433 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ENPP5Q9UJA9 477 aa13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 UBE2QL1A1L167 161 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PTP4A3O75365 173 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 DNTTP04053 509 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 STAT5AP42229 794 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 NDUFV1P49821 464 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 GPX6P59796 221 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 TFDP2Q14188 446 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 SLC1A5Q15758 541 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 UGT3A2Q3SY77 523 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 TMEM31Q5JXX7 168 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CERCAMQ5T4B2 595 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CACUL1Q86Y37 369 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 SLC9A9Q8IVB4 645 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 NAT16Q8N8M0 369 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 IL17RCQ8NAC3 791 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CORO2AQ92828 525 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PKP2Q99959 881 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 SNED1Q8TER0 1413 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CHP2O43745 196 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 FECHP22830 423 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 GRIA1P42261 906 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 RGS1Q08116 209 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ASB7Q9H672 318 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 FBXO10Q9UK96 956 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 H0YGN5 161 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ADAM11O75078 769 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 AVILO75366 819 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 HK1P19367 917 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 KCNJ11Q14654 390 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 TRIB2Q92519 343 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 SENP8Q96LD8 212 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 EVA1BQ9NVM1 165 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 NFS1Q9Y697 457 aa13.41□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 FHP07954 510 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 STOMP27105 288 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 LHX1P48742 406 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ERV3-1Q14264 604 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 VMACQ2NL98 169 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ZNF773Q6PK81 442 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 KCT2Q8NC54 265 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 STON2Q8WXE9 905 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PPM1MQ96MI6 270 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 DDIT4Q9NX09 232 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 DHRS12A0PJE2 317 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 FABP12A6NFH5 140 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PRAMEF1O95521 474 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ANXA3P12429 323 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 LCN1P31025 176 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 INAVAQ3KP66 663 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 CARFQ8N187 725 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms