RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB28P51157 221 aa26.84■■□□□ 1.89
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TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNX31Q8N9S9 440 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 LINC01555Q8NAE3 123 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4K3Q96R72 315 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 MID1IP1Q9NPA3 183 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAJC11Q9NVH1 559 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDH15Q96QU1 1955 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGAP33O14559 1287 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 MLYCDO95822 493 aa26.83■■□□□ 1.89
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TRAPPC10-202ENST00000380221 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
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TRAPPC10-202ENST00000380221 HSD17B2P37059 387 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAZP56270 477 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR18Q14330 331 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC9B2Q86UD5 537 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB42Q8N4Z0 105 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2I1PQ8NGU4 316 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGAP11Q8TF27 550 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDK15Q96Q40 435 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUF2Q9BZD4 464 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF225Q9UK10 706 aa26.83■■□□□ 1.89
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TRAPPC10-202ENST00000380221 TCF15Q12870 199 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL27RAQ6UWB1 636 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 GATAD2AQ86YP4 633 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4E2Q8NGC2 313 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 LCN9Q8WX39 176 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP6V1E2Q96A05 226 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAR2Q96K12 515 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 SGPP1Q9BX95 441 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 FIS1Q9Y3D6 152 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC22O60826 627 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 GIMD1P0DJR0 217 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCTRP47872 440 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLCL1Q15111 1095 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPDYAQ5MJ70 313 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYVN1Q86TM6 617 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIRREL3Q8IZU9 778 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRSS33Q8NF86 280 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP1R36Q96LQ0 422 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 GMEB2Q9UKD1 530 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAF6Q9Y4K3 522 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF839A8K0R7 811 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM1AO60341 852 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 JUNP05412 331 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINA6P08185 405 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIK3CGP48736 1102 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNG1P51959 295 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCEAL6Q6IPX3 200 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 OGFOD3Q6PK18 319 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARL14Q8N4G2 192 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2L8Q8NGY9 312 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCEAL3Q969E4 200 aa26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 KATNA1O75449 491 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYPP08247 313 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPPBP16860 134 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDC16Q13042 620 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 AMIGO1Q86WK6 493 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAP25Q8TEE9 199 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFPM2Q8WW38 1151 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF382Q96SR6 550 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PPV9 198 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 DFNA5O60443 496 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERVPABLB-1P60509 514 aa26.79■■□□□ 1.88
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TRAPPC10-202ENST00000380221 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4F6Q8NGB9 312 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMPDL3AQ92484 453 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 SH3KBP1Q96B97 665 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNA7Q96RP8 456 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACAT2Q9BWD1 397 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCF7L2Q9NQB0 619 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARMCX1Q9P291 453 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 GOLGA8OA6NCC3 632 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRPC5OSA6NMA1 111 aa26.79■■□□□ 1.88
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