RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 GUCY2DQ02846 1103 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 DRP2Q13474 957 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ACVR2BQ13705 512 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 TAF5Q15542 800 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 USP41Q3LFD5 358 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CFAP221Q4G0U5 840 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ZCWPW2Q504Y3 356 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SLC10A5Q5PT55 438 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 DCST1Q5T197 706 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 KCTD16Q68DU8 428 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 C8orf74Q6P047 294 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC91Q7Z6B0 441 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 RPAINQ86UA6 219 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 IFT81Q8WYA0 676 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJC19Q96DA6 116 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CABS1Q96KC9 395 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 MTMR9Q96QG7 549 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 PSMB7Q99436 277 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 KRT12Q99456 494 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 LZTS2Q9BRK4 669 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM51Q9BSJ1 452 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ZMYND12Q9H0C1 365 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 POLD4Q9HCU8 107 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 AIPL1Q9NZN9 384 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM181Q9P2C4 612 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 KAT6BQ8WYB5 2073 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 MYH7BA7E2Y1 1941 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 A0A087X0T9 212 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 MEIOCA2RUB1 952 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 GMNCA6NCL1 334 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 OR5K3A6NET4 321 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SMCO2A6NFE2 343 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 C5orf60A6NFR6 353 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 TSPY2A6NKD2 308 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 A6NL46 340 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 BTNL10A8MVZ5 291 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 DNM1LO00429 736 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CHUKO15111 745 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA0754O94854 1291 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 NR3C1P04150 777 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 FAM228BP0C875 321 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CEACAM1P13688 526 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 HSD17B3P37058 310 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CRKLP46109 303 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 NT5C2P49902 561 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 MNAT1P51948 309 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 NAPAP54920 295 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CDH15P55291 814 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ARL4CP56559 192 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SLC8A3P57103 927 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 TNNC1P63316 161 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC63Q05C16 580 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 IFT88Q13099 833 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ITPK1Q13572 414 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SLC12A1Q13621 1099 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 PDIA5Q14554 519 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 LETM2Q2VYF4 491 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CAVIN4Q5BKX8 364 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 WLSQ5T9L3 541 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SLFN11Q7Z7L1 901 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 FAM228AQ86W67 206 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 TBCKQ8TEA7 893 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 RAPGEF5Q92565 580 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 RAD54LQ92698 747 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 PHF21AQ96BD5 680 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CALML4Q96GE6 196 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 RUFY1Q96T51 708 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SPZ1Q9BXG8 430 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms