RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 XIAPP98170 497 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SPAG1Q07617 926 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SPOCK1Q08629 439 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RIGQ13278 110 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 APOFQ13790 326 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RCN2Q14257 317 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 STK38Q15208 465 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TGFBIQ15582 683 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 LONRF1Q17RB8 773 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SNX30Q5VWJ9 437 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 C8orf74Q6P047 294 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RRAGAQ7L523 313 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 LONP2Q86WA8 852 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 DSELQ8IZU8 1212 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ALLCQ8N6M5 410 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 PDILTQ8N807 584 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SPERTQ8NA61 448 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 HSPH1Q92598 858 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ATP6V0A1Q93050 837 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 HAUS1Q96CS2 278 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC42Q96M95 316 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 BIRC8Q96P09 236 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SLC39A3Q9BRY0 314 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SYT11Q9BT88 431 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 USP44Q9H0E7 712 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 C12orf10Q9HB07 376 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 POLD4Q9HCU8 107 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SAR1AQ9NR31 198 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CHST12Q9NRB3 414 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 GIN1Q9NXP7 522 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TSPYL4Q9UJ04 414 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 GUCA1BQ9UMX6 200 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SLIT1O75093 1534 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TIAM2Q8IVF5 1701 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF609O15014 1411 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 AKAP11Q9UKA4 1901 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0D9SFI3 127 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TTC26A0AVF1 554 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 FUOMA2VDF0 154 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 LGALS16A8MUM7 142 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 FAM25EA8MYX2 175 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM114B3SHH9 223 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 FBP2O00757 339 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 BAIAP3O94812 1187 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TFAP2AP05549 437 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RARGP13631 454 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CD58P19256 250 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 GNA11P29992 359 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 HNF1BP35680 557 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 BCAP31P51572 246 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 RAP1GDS1P52306 607 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 SLC34A1Q06495 639 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 KRT31Q15323 416 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms