RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 NAXDQ8IW45 347 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBQLNLQ8IYU4 475 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDK20Q8IZL9 346 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF525Q8N782 197 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC37A3Q8NCC5 494 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR52B6Q8NGF0 335 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5T2Q8NGG2 359 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 POF1BQ8WVV4 589 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIPA1Q96FS4 1042 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R16AQ96I34 528 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C8orf48Q96LL4 319 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM81BQ96LP2 452 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDOQ99489 341 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 LPAR4Q99677 370 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAGR1Q9BTK6 254 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CUTCQ9NTM9 273 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OSER1Q9NX31 292 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPHK1Q9NYA1 384 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHCGQ9UBD6 479 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 STUB1Q9UNE7 303 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCG2Q9UNQ0 655 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAMK2AQ9UQM7 478 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIAS3Q9Y6X2 628 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHD1A6NEE1 506 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2orf81A6NN90 581 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ENO4A6NNW6 628 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 K7EQG2 157 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFSF11O14788 317 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OGG1O15527 345 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDUFS4O43181 175 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TXNL1O43396 289 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HCRTR2O43614 444 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAGE4O60829 102 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A12O75746 678 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDPCPO95876 746 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP1A3P13637 1013 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYOGP15173 224 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDH3P22223 829 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 AXLP30530 894 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTGER4P35408 488 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHKAP35790 457 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PMELP40967 661 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MEOX2P50222 304 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCR3P51677 355 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRPXP78539 464 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP2R2BQ00005 443 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTP4A2Q12974 167 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITPK1Q13572 414 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM14Q14142 442 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ISXQ2M1V0 245 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM44Q2T9K0 475 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRAMD1BQ3KR37 738 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF506Q5JVG8 444 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM198Q66K66 360 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ASPHD2Q6ICH7 369 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC73Q6P1J9 531 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSTA5Q7RTV2 222 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFAP206Q8IYR0 622 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP57L1Q8IYX8 460 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 AFAP1Q8N556 730 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPFIBP2Q8ND30 876 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPEPL1Q8NDH3 523 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR6T1Q8NGN1 323 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5M8Q8NGP6 311 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D16Q8TBP0 767 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELSPBP1Q96BH3 223 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NTNG2Q96CW9 530 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SGF29Q96ES7 293 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIP5K1AQ99755 562 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C16orf70Q9BSU1 422 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IKZF5Q9H5V7 419 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARNT2Q9HBZ2 717 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NLGN3Q9NZ94 848 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB26Q9ULW5 256 aa0.24□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms