RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 LLGL1Q15334 1064 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 KCNMB1Q16558 191 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CARTPTQ16568 116 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TMPRSS6Q8IU80 811 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 UBA3Q8TBC4 463 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ELP5Q8TE02 316 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 RIT1Q92963 219 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SHDQ96IW2 340 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PFDN5Q99471 154 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CEP41Q9BYV8 373 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 NIF3L1Q9GZT8 377 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SPNS1Q9H2V7 528 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GAREM1Q9H706 876 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TREM2Q9NZC2 230 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.85□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 B4E171 279 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 E9PAM4 449 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 J3QW42 95 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 INPPL1O15357 1258 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SPAG6O75602 509 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM63AO94886 807 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 LRG1P02750 347 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 STAG3L3P0CL85 134 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CBSLP0DN79 551 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CD19P15391 556 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TCF4P15884 667 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TAC1P20366 129 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CBSP35520 551 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CLCQ05315 142 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 STX4Q12846 297 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SEMA3BQ13214 749 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 OR2B11Q5JQS5 317 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SPRYD7Q5W111 196 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 EEF1DP3Q658K8 133 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 BBS12Q6ZW61 710 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF454Q8N9F8 522 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 KYQ8NBH2 561 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 OR5T1Q8NG75 326 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ELMO1Q92556 727 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 ALG3Q92685 438 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TMCO6Q96DC7 493 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 OTUB2Q96DC9 234 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 MTERF3Q96E29 417 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 LGMNQ99538 433 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CDT1Q9H211 546 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FZD8Q9H461 694 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 COPZ2Q9P299 210 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 RNF24Q9Y225 148 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 EVPLQ92817 2033 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 SCN4AP35499 1836 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 A0A0A0MRY4 1105 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1B0GVM2 712 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CDC7O00311 574 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 TLR5O60602 858 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 CSTAP01040 98 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PRR35P0CG20 571 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 PSMC3P17980 439 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 HNF1AP20823 631 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 POU1F1P28069 291 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 GCAP28676 217 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-201ENST00000325897 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.3 ms