RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 H3BM21 787 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TMEM45AQ9NWC5 275 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ASB4Q9Y574 426 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 NCEH1Q6PIU2 408 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ZFP57Q9NU63 452 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 COL20A1Q9P218 1284 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.57■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CBSLP0DN79 551 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CBSP35520 551 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MAP3K8P41279 467 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ACTC1P68032 377 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ACTA1P68133 377 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 GRK1Q15835 563 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CCDC54Q8NEL0 328 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SLX4Q8IY92 1834 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MFSD11O43934 449 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 DPYSL2Q16555 572 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RAB41Q5JT25 222 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 DUSP26Q9BV47 211 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 hCG_2039718K7EN88 272 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SPTLC1O15269 473 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CPN2P22792 545 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TGFBIQ15582 683 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CHIAQ9BZP6 476 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RAB39AQ14964 217 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ACER1Q8TDN7 264 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TOR3AQ9H497 397 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ASAH2Q9NR71 780 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TSTD3H0UI37 97 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ALG10Q5BKT4 473 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SCML4Q8N228 414 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 GKN3PP0CG01 181 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PTTG3PQ9NZH4 202 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CRYZL1O95825 349 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 OR4K2Q8NGD2 314 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TAS2R8Q9NYW2 309 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MATN3O15232 486 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CHMP24386 653 aa16.56■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ALPPP05187 535 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 NFE2L1Q14494 772 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 Q8N402 240 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ISM1B1AKI9 464 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 UPP2O95045 317 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 LGI4Q8N135 537 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 OR2AG2A6NM03 316 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RPS2P15880 293 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 GRK6P43250 576 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 HAPLN3Q96S86 360 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 FAIMQ9NVQ4 179 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 YDJCA8MPS7 323 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MEIS2O14770 477 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 IFNA2P01563 188 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ZNF132P52740 706 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 KCNC4Q03721 635 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 KCNJ11Q14654 390 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 L1CAMP32004 1257 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 GPR21Q99679 349 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RGCCQ9H4X1 137 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RGPD5Q99666 1765 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TSPAN8P19075 237 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SCARB2Q14108 478 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PAOXQ6QHF9 649 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 IFT52Q9Y366 437 aa16.55■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 OR6C75A6NL08 312 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CLDN4O14493 209 aa16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms