RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 IST1P53990 364 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM74Q86UV6 250 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM73Q86UV7 250 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA10O75578 1167 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 YES1P07947 543 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 GSK3BP49841 420 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKL1Q00532 357 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SYCE2Q6PIF2 218 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5AK3PQ8NH89 298 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 OPN1SWP03999 348 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 FLT3LGP49771 235 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 RGMBQ6NW40 437 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf66Q96MD2 445 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 FZD8Q9H461 694 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CLPXO76031 633 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGN1P05114 100 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SMPD1P17405 629 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CSKP41240 450 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMG2Q02383 582 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 DUOXA1Q1HG43 343 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 NXPE1Q8N323 547 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC107Q8WV48 283 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 MIPEPQ99797 713 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.61■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF3P17036 446 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFA5Q01523 94 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PHTF2Q8N3S3 785 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 COQ8BQ96D53 544 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 COL21A1Q96P44 957 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB26Q9HCK0 441 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 J3QRK9 145 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 IRAK2O43187 625 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 RLN2P04090 185 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCN7P51798 805 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 NUP54Q7Z3B4 507 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT7Q86SF2 657 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PYCR2Q96C36 320 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXL8Q96CD0 374 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPBAP1Q96EW2 488 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 YIPF4Q9BSR8 244 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 P2RX2Q9UBL9 471 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 HAS3O00219 553 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAMP1O15126 338 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PGAM2P15259 253 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SFT2D3Q587I9 215 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ERMP1Q7Z2K6 904 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCZ1Q86YW0 608 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL6Q8WZ60 621 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTR3BQ9P1U1 418 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 OR1I1O60431 355 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 MPIP34949 423 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC42Q9Y546 428 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 KMOO15229 486 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 UBXN7O94888 489 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 CFHP08603 1231 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PGDP52209 483 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 UFM1P61960 85 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBA1BP68363 451 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC18A2Q05940 514 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBA1AQ71U36 451 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 BRD7Q9NPI1 651 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa23.6■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PEX10O60683 326 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PEPDP12955 493 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR23BQ6ZRT6 265 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 COPS7AQ9UBW8 275 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ENTPD6O75354 484 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 SP140Q13342 867 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT13Q86X67 352 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 TMED9Q9BVK6 235 aa23.59■■□□□ 1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTM3P21266 225 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms