RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 KCNE2Q9Y6J6 123 aa22.05■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3LB9A6J9 549 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3HP0C7X1 549 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 NPPBP16860 134 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TAP2Q03519 686 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 RPA4Q13156 261 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 TACR1P25103 407 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 HNF4AP41235 474 aa22.04■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 LRRC36Q1X8D7 754 aa22.04■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 LPCAT4Q643R3 524 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 NANOGP8Q6NSW7 305 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 DLEU7Q6UYE1 221 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 FAM124AQ86V42 546 aa22.04■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 MYOCQ99972 504 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 NANOGQ9H9S0 305 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 CD93Q9NPY3 652 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.04■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 H0YIV9 168 aa22.03■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 AMD1P17707 334 aa22.03■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TEAD1P28347 426 aa22.03■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 IGFALSP35858 605 aa22.03■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 PNLIPRP1P54315 467 aa22.03■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 METRNLQ641Q3 311 aa22.03■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP1Q6P2D0 407 aa22.03■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 HSD17B1P14061 328 aa22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 SDC1P18827 310 aa22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 SLC13A3Q8WWT9 602 aa22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 TSSK3Q96PN8 268 aa22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 NRTNQ99748 197 aa22.02■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 EGFL7Q9UHF1 273 aa22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.02■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 PPP2CAP67775 309 aa22.02■■□□□ 1.12
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VSTM4-201ENST00000298454 PQLC1Q8N2U9 271 aa22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 PPM1MQ96MI6 270 aa22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
VSTM4-201ENST00000298454 SLC31A1O15431 190 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 LATO43561 262 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 NPPAP01160 153 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 C8BP07358 591 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ACP5P13686 325 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PEX2P28328 305 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 OR7G3Q8NG95 312 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 EGLN2Q96KS0 407 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 EBPLQ9BY08 206 aa22.01■■□□□ 1.11
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