RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR174Q9BXC1 333 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 EML2O95834 649 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT6AP02538 564 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT6BP04259 564 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT6CP48668 564 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 CCR5P51681 352 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 STX1BP61266 288 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 FRG2Q64ET8 278 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR92Q96MX6 357 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 FRG2BQ96QU4 278 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX6Q9UNH7 406 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC28A1O00337 649 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD28O15084 1053 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 RGS14O43566 566 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 APBB3O95704 486 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 G6PDP11413 515 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 GNAZP19086 355 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPN3P20807 821 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 KELP23276 732 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 IL12AP29459 219 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 CD6P30203 668 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 CASP2P42575 452 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 DPP6P42658 865 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 RAP1GDS1P52306 607 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 UFM1P61960 85 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 TCEA2Q15560 299 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZSR6 202 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 RETREG3Q86VR2 466 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 KYQ8NBH2 561 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDT8Q8WV74 236 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf66Q96MD2 445 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2M4Q96R27 311 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 ELOVL6Q9H5J4 265 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNJ13O60928 360 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 AKT2P31751 481 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 GRIK2Q13002 908 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 LRP8Q14114 963 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 IL23RQ5VWK5 629 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 OR13H1Q8NG92 308 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SHDQ96IW2 340 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SERTM1A2A2V5 107 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 H0YIV9 168 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC2A4P14672 509 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 YPEL5P62699 121 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG11Q2TAA5 492 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 REP15Q6BDI9 236 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SPDL1Q96EA4 605 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR34Q96EX3 536 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms