RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 KLHL35Q6PF15 583 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PQY0 241 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PPP6CO00743 305 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ADH1AP07327 375 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 IL7RP16871 459 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 IFNGR2P38484 337 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GNA13Q14344 377 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CES5AQ6NT32 575 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 OXR1Q8N573 874 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 YME1L1Q96TA2 773 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CLMPQ9H6B4 373 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GABRQQ9UN88 632 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NEU3Q9UQ49 428 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 POFUT2Q9Y2G5 429 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CLIC3O95833 236 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PDYNP01213 254 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 UGT2B4P06133 528 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PFKLP17858 780 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 VIPR1P32241 457 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 HTR6P50406 440 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GGTA1PQ4G0N0 100 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PARP8Q8N3A8 854 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ITPAQ9BY32 194 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CAPNS1P04632 268 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 IMPDH2P12268 514 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 JUPP14923 745 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CLCN7P51798 805 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RTP2Q5QGT7 225 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GPR149Q86SP6 731 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD46Q86W74 232 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ITPKCQ96DU7 683 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CASD1Q96PB1 797 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GULP1Q9UBP9 304 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CDH7Q9ULB5 785 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 MCM3APO60318 1980 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 LCTP09848 1927 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 XYLBO75191 536 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GUCY1B2O75343 617 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PRR35P0CG20 571 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CXCR4P61073 352 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NAE1Q13564 534 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 NCF4Q15080 339 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 TESCQ96BS2 214 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 EFCAB11Q9BUY7 163 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SRRDQ9UH36 339 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 SLC1A7O00341 560 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF9O43307 516 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 HSMCR30P0CW71 290 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GDF5P43026 501 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 PTGR1Q14914 329 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 INAQ16352 499 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 VMACQ2NL98 169 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-201ENST00000264345 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms