RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PLD3Q8IV08 490 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 DACH2Q96NX9 599 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TSSK3Q96PN8 268 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RASSF1Q9NS23 344 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CLDN24A6NM45 220 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 FZD6O60353 706 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 GJB5O95377 273 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SEMG1P04279 462 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 EPORP19235 508 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 FPR1P21462 350 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 VLDLRP98155 873 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 GALNT10Q86SR1 603 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TRIB2Q92519 343 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 LHX3Q9UBR4 397 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CLDN9O95484 217 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 KLKB1P03952 638 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TPTEP56180 551 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CDC20Q12834 499 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SLC13A2Q13183 592 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 AHSA2Q719I0 299 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RBFAQ8N0V3 343 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZBTB2Q8N680 514 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 MCFD2Q8NI22 146 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 STARD8Q92502 1023 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ASB8Q9H765 288 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.52□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 OR6C75A6NL08 312 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 RFXANKO14593 260 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 STK16O75716 305 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 UPK1BO75841 260 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 LRATO95237 230 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 KRT6AP02538 564 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 KRT6BP04259 564 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 FABP3P05413 133 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 KRT6CP48668 564 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 CAP1Q01518 475 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 DUSP4Q13115 394 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SERPINA11Q86U17 422 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 LACC1Q8IV20 430 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ELMOD1Q8N336 334 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 APH1BQ8WW43 257 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 NACA2Q9H009 215 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 KRT84Q9NSB2 600 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.52□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PCDHGA12O60330 932 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 BMP1P13497 986 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SDC1P18827 310 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 NEK2P51955 445 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 CREMQ03060 361 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF7Q14155 803 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PROX2Q3B8N5 592 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 UBE2UQ5VVX9 321 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 HORMAD1Q86X24 394 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 TESCQ96BS2 214 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 EGLN2Q96KS0 407 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SP140LQ9H930 580 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms