RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 SIGLEC11Q96RL6 698 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 COCHO43405 550 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 PGLSO95336 258 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF682O95780 498 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGALP20701 1170 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 FUT4P22083 530 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ACRV1P26436 265 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 NCS1P62166 190 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 LAPTM4AQ15012 233 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 INAVAQ3KP66 663 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ARMC12Q5T9G4 340 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD46Q86W74 232 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF540Q8NDQ6 660 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 HEPHQ9BQS7 1158 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 LATS2Q9NRM7 1088 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 OSGIN1Q9UJX0 560 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CLDN24A6NM45 220 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 RHOAP61586 193 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC14A1Q13336 389 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 DOK6Q6PKX4 331 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC81Q6ZN84 652 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO19Q96H55 970 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 GPRC5BQ9NZH0 403 aa21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 E9PQ18 207 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 NPIPB8E9PQR5 432 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SEPT4O43236 478 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 B3GALT4O96024 378 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CDKL4Q5MAI5 379 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 HECTD3Q5T447 861 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 LGALS12Q96DT0 336 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 IL26Q9NPH9 171 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MARCH5Q9NX47 278 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 FADS2O95864 444 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CTGFP29279 349 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TGFBR2P37173 567 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.043e-6■■■□□ 16.5
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 GGTA1PQ4G0N0 100 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 RHOXF1Q8NHV9 184 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIB2Q92519 343 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 PITX2Q99697 317 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 RHNO1Q9BSD3 238 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC32A1Q9H598 525 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa21.54■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 HTR3EA5X5Y0 456 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 RFXANKO14593 260 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 FABP3P05413 133 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SDC1P18827 310 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TACR1P25103 407 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 DGCR6Q14129 220 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SELENOMQ8WWX9 145 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CMTM7Q96FZ5 175 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TSSK3Q96PN8 268 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 GKN1Q9NS71 199 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS6KA6Q9UK32 745 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2A25A4D2G3 310 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM20BO75063 409 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ANXA5P08758 320 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP5CP53041 499 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 AP1S1P61966 158 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 IL1RL1Q01638 556 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF7Q14155 803 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 PGS1Q32NB8 556 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 RTP2Q5QGT7 225 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 LACC1Q8IV20 430 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TMED5Q9Y3A6 229 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 EVPLLA8MZ36 301 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO1GB0I1T2 1018 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ACPPP15309 386 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPK1P28482 360 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPC1P48995 793 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MTAPQ13126 283 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 DNASE1L3Q13609 305 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MBTPS1Q14703 1052 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 VMACQ2NL98 169 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 PROX2Q3B8N5 592 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 UBE2UQ5VVX9 321 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ZZZ3Q8IYH5 903 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 DSN1Q9H410 356 aa21.53■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 EPS8L2Q9H6S3 715 aa21.53■■□□□ 1.04
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