RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018482.12

Tnip1-201, Transcript of TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tnip1, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa11.21□□□□□ -0.61
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cacna1cQ01815 2139 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 ThadaA8C756 1938 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm13276A0A087WR18 182 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Trabd2bB1ATG9 517 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gstp3F6RWR5 210 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Msl3l2G3X992 371 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Vmn2r58K7N6V2 862 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Vmn2r1O70410 912 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 H2-EaP01904 255 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 P04224 255 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 H2-Eb1P04230 264 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 JunP05627 334 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Sbk3P0C5K0 361 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cox5bP19536 128 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 UoxP25688 303 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Csf3rP40223 837 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 AcadvlP50544 656 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 UrodP70697 367 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 AurkaP97477 395 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Q3TTL0 348 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Zfp217Q3U0X6 1041 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm14851Q5ERJ0 116 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Olfr8Q60892 310 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 CfiQ61129 603 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Colgalt2Q6NVG7 625 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Krba1Q6NXZ1 1043 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ssx9Q6XAS3 170 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm21627Q810R0 219 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gpr171Q8BG55 319 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Lair1Q8BG84 263 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 DpcdQ8BPA8 203 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rap2cQ8BU31 183 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Q8CDN1 933 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ahi1Q8K3E5 1047 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Olfr1250Q8VGM3 314 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 CtsqQ91ZF4 343 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Q9D979 236 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cyp3a41aQ9JMA7 504 aa11.21□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm1330D3Z460 184 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Vmn2r96E9PZU5 664 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Kcnc1P15388 511 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 MutP16332 748 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Il6raP22272 460 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Psme3P61290 254 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tbx1P70323 479 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tmem207P86045 143 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Hrh2P97292 397 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rps5P97461 204 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 JupQ02257 745 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Dlx3Q64205 287 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tas2r115Q7M719 310 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rgs7bpQ8BQP9 257 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cypt1Q8CH20 168 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Timd2Q8R183 305 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Acsm1Q91VA0 573 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Lims2Q91XD2 341 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Atpaf2Q91YY4 289 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Coro6Q920M5 471 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Znf639Q99KZ6 485 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rwdd2bQ99M03 290 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Clec2gQ9D676 269 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tspan4Q9DCK3 238 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Olfr711Q9EPG2 314 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 RhojQ9ER71 214 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Hipk3Q9ERH7 1192 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 PnckQ9QYK9 343 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Kcnk7Q9Z2T1 307 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm28363A0A087WQW2 129 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm5485A0A1D5RM98 91 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rhox2bA2A447 191 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Zfp982A2A8Q4 368 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rhox2cA2AWL9 191 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Zfp882E9Q4R4 555 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Vmn1r12G5E8G1 307 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Usp2O88623 613 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Eef1a1P10126 462 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Il1r1P13504 576 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 H2-D1P14427 368 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 FshrP35378 692 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cd63P41731 238 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Upf3aQ3ULJ3 422 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Glp2rQ5IXF8 512 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Atg16l2Q6KAU8 623 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Acp6Q8BP40 418 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Sept10Q8C650 452 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 CcinQ8CDE2 588 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Lrrc56Q8K375 552 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Prrg2Q8R182 198 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gsg1Q8R1W2 324 aa11.2□□□□□ -0.62
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Zfp566Q8VCI1 386 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.9 ms