RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.48□□□□□ -0.57
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.46□□□□□ -0.57
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITM2BQ9Y287 266 aa11.46□□□□□ -0.57
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADH1AP07327 375 aa11.46□□□□□ -0.57
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPM1AP35813 382 aa11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIGFQ07326 219 aa11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VAC14Q08AM6 782 aa11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CES5AQ6NT32 575 aa11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOXRED1Q6NXP6 359 aa11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa11.46□□□□□ -0.57
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TDP1Q9NUW8 608 aa11.46□□□□□ -0.57
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