RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 HCFC1P51610 2035 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FAM72CH0Y354 149 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ALOX12BO75342 701 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CTAG2O75638 210 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 GNA14O95837 355 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 VIPP01282 170 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SHBGP04278 402 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.64e-7■■■□□ 17.1
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HCG18-241ENST00000602290 MARSP56192 900 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FOXL2P58012 376 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SLC6A3Q01959 620 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 GCNT1Q02742 428 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 GSTM4Q03013 218 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 MFAP5Q13361 173 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SLC18A3Q16572 532 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 MAN2A1Q16706 1144 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A52Q3SY17 297 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TRNP1Q6NT89 227 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 RFLNAQ6ZTI6 216 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ACAD11Q709F0 780 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.28□□□□□ -0.6
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HCG18-241ENST00000602290 SPATA24Q86W54 205 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FAM72BQ86X60 149 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FAM131BQ86XD5 332 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 VSIG1Q86XK7 387 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 KLHL7Q8IXQ5 586 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 LMO3Q8TAP4 145 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.28□□□□□ -0.6
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HCG18-241ENST00000602290 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 NT5C1BQ96P26 610 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CD180Q99467 661 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 AGAP2Q99490 1192 aa11.28□□□□□ -0.6
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HCG18-241ENST00000602290 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.28□□□□□ -0.6
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HCG18-241ENST00000602290 ADAM10O14672 748 aa11.27□□□□□ -0.61
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HCG18-241ENST00000602290 TNFSF10P50591 281 aa11.27□□□□□ -0.61
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HCG18-241ENST00000602290 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.27□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 GTF3C1Q12789 2109 aa11.27□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.26□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.26□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 WASH4PA8MWX3 477 aa11.26□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 MATN2O00339 956 aa11.26□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 MED7O43513 233 aa11.26□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 PRAMEF2O60811 474 aa11.26□□□□□ -0.61
HCG18-241ENST00000602290 CCDC22O60826 627 aa11.26□□□□□ -0.61
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