RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK15Q8TD08 544 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 RILPQ96NA2 401 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC28BQ9BUN5 200 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC61Q9BV99 259 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC29A3Q9BZD2 475 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 NUF2Q9BZD4 464 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SPASTQ9UBP0 616 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 FIS1Q9Y3D6 152 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GTL3 188 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 DPP6P42658 865 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB28P51157 221 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF542PQ5EBM4 170 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRT3Q5FWE3 981 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL21CQ5VZV1 264 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPJQ5W064 366 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 IYDQ6PHW0 289 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf89Q6UWU4 347 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 L3MBTL4Q8NA19 623 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TWIST2Q8WVJ9 160 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SMPDL3AQ92484 453 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf40BQ96DE9 158 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 EBF4Q9BQW3 602 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTR8Q9H981 624 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CIDEBQ9UHD4 219 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 VCANP13611 3396 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CLGNO14967 610 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 GNAZP19086 355 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 BTKQ06187 659 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 LCTLQ6UWM7 567 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 LAYNQ6UX15 382 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 GKN2Q86XP6 184 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL6Q8TCB7 284 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC37BQ96QE4 947 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HAUS8Q9BT25 410 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF7L2Q9NQB0 619 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN32Q9NX65 697 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HEY2Q9UBP5 337 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 EML2O95834 649 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 AVPR2P30518 371 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HMOX2P30519 316 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXA1P55317 472 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CDYL2Q8N8U2 506 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 AVL9Q8NBF6 648 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PPFIBP2Q8ND30 876 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2L8Q8NGY9 312 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 POT1Q9NUX5 634 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 DYRK1BQ9Y463 629 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC22O60826 627 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPN1P07384 714 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PKLRP30613 574 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CASP2P42575 452 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 E2F2Q14209 437 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52E1Q8NGJ3 308 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTRT2Q8TDY3 377 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf60Q96EN9 201 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK15Q96Q40 435 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4K3Q96R72 315 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNA7Q96RP8 456 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HRO43593 1189 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS4BO75351 444 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXD12P35452 270 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC19A1P41440 591 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF33BQ06732 778 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TUBB3Q13509 450 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TBCCQ15814 346 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP70Q8NHQ1 597 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 EHD1Q9H4M9 534 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PILRBQ9UKJ0 227 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PLAGL1Q9UM63 463 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM33Q9UPN9 1127 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SDHDO14521 159 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 WFS1O76024 890 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINA6P08185 405 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 NPPBP16860 134 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINB3P29508 390 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SHMT2P34897 504 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HNF4AP41235 474 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 IRF8Q02556 426 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CHIT1Q13231 466 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB44Q8NCP5 570 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 IL17FQ96PD4 163 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 MRGBPQ9NV56 204 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM22Q9Y584 194 aa30.03■■■□□ 2.4
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