RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-216ENST00000588477 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 PSMF1Q92530 271 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 GBP4Q96PP9 640 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 H7C0S8 307 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 USP1O94782 785 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 RASAL1O95294 804 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 FTH1P02794 183 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 UQCRHP07919 91 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 PRR35P0CG20 571 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 SOX11P35716 441 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 NSG1P42857 185 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 OCA2Q04671 838 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 RBPJQ06330 500 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 SPARCL1Q14515 664 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 TESK1Q15569 626 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 DBN1Q16643 649 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 SYTL3Q4VX76 610 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ATG9BQ674R7 924 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 MIEF2Q96C03 454 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 TBL1YQ9BQ87 522 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ABI3Q9P2A4 366 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 C19orf84I3L1E1 186 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 QSOX1O00391 747 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 MBD3O95983 291 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 PKLRP30613 574 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 SSTR2P30874 369 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 RAB28P51157 221 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 TPM4P67936 248 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 CACNG1Q06432 222 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 C3orf18Q9UK00 162 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-216ENST00000588477 HYKKA2RU49 373 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 KCNN4O15554 427 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 PSTPIP1O43586 416 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 WFS1O76024 890 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 MED26O95402 600 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 COX6A1P12074 109 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CD9P21926 228 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CASP6P55212 293 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 LUZP1Q86V48 1076 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 IL17FQ96PD4 163 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 MENTQ9BUN1 341 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 FITM1A5D6W6 292 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms