RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 RAPSNQ13702 412 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 DSC3Q14574 896 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MBTPS1Q14703 1052 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 VMACQ2NL98 169 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PYCR3Q53H96 274 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ALFQ53S48 1182 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 XKRXQ6PP77 449 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SBSNQ6UWP8 590 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ENPP6Q6UWR7 440 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CBLL1Q75N03 491 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 IL17RCQ8NAC3 791 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFP90Q8TF47 636 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 HPS1Q92902 700 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FCRL1Q96LA6 429 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL5Q96PQ7 755 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC32A1Q9H598 525 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 NMUR1Q9HB89 426 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SPON1Q9HCB6 807 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FZD1Q9UP38 647 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC12A8A0AV02 714 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 IRGMA1A4Y4 181 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 QSOX1O00391 747 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP6CO00743 305 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 UGT2B17O75795 530 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FTH1P02794 183 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SEMG1P04279 462 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GSTT2P0CG29 244 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GSTT2BP0CG30 244 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MPC1LP0DKB6 136 aa7.53□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 BCKDHAP12694 445 aa7.53□□□□□ -1.2
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CAPNS1-202ENST00000586851 CD72P21854 359 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 KDELR2P33947 212 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GGT2P36268 569 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PIK3CBP42338 1070 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 HK3P52790 923 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 UGT2B15P54855 530 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MGAT3Q09327 533 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 EFEMP1Q12805 493 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 NPRL3Q12980 569 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GALNT3Q14435 633 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNJ8Q15842 424 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CCL15Q16663 113 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM26DQ5JW98 314 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PERM1Q5SV97 790 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MORN1Q5T089 497 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RNLSQ5VYX0 342 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RAP1GAP2Q684P5 730 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 IL31Q6EBC2 164 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GCNT7Q6ZNI0 430 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PAGE2Q7Z2X7 111 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CHPFQ8IZ52 775 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 LIX1Q8N485 282 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 NATD1Q8N6N6 113 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.53□□□□□ -1.2
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