RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT8Q16880 541 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 GALNT7Q86SF2 657 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNTN4Q8IWV2 1026 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 THAP4Q8WY91 577 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 INPP5DQ92835 1189 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM136AQ96C01 138 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNF8Q96H20 258 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHST8Q9H2A9 424 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHRS7Q9Y394 339 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLK4Q9Y5K2 254 aa16.46■□□□□ 0.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9J4A7 227 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO1CO00159 1063 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS26AO75436 327 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD63P08962 238 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPC1LP0DKB6 136 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERGP11308 486 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIF1AQ16665 826 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 BBS9Q3SYG4 887 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSS51Q4VC12 460 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHBDD2Q6NTF9 364 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLG3Q92796 817 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GALPQ9UBC7 116 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MED16Q9Y2X0 877 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.45■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF33A8MVX0 844 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTI1O43156 1089 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAUS5O94927 633 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARL4CP56559 192 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCTE1Q5JU00 501 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 BBOF1Q8ND07 529 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD200R1Q8TD46 325 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASB11Q8WXH4 323 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMPDL3AQ92484 453 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CERS2Q96G23 380 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR21Q99679 349 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 EURLQ9NYK6 297 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPTBP11277 2137 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC14CA4D256 554 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERVK-10P10266 1014 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITGA8P53708 1063 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PMS2P54278 862 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARSFP54793 590 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ETF1P62495 437 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPP1Q00013 466 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFATC3Q12968 1075 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CBLBQ13191 982 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCF4Q15080 339 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 STEAP4Q687X5 459 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAX1BP1Q86VP1 789 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2L3Q8NG85 312 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2A1Q8NGT9 310 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms