RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538827.5

CD4-208, Transcript of CD4 molecule, human

TSL 1 (best)

Gene CD4, Length 985 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD4-208	ENST00000538827	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	CD244	Q9BZW8	370 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	DRC3	Q9H069	523 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	XKR8	Q9H6D3	395 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	POLG2	Q9UHN1	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827		A0A0G2JNG1	304 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827		K7EPI3	171 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	E2F3	O00716	465 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	GIPC1	O14908	333 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	YY2	O15391	372 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	CRCP	O75575	148 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	KIT	P10721	976 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	PKLR	P30613	574 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ARRB2	P32121	409 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	SERPINB5	P36952	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	SLC19A1	P41440	591 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	SLC6A12	P48065	614 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	OCRL	Q01968	901 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	BNIP3	Q12983	259 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	GRB7	Q14451	532 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	NAGS	Q8N159	534 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	C7orf26	Q96N11	449 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	SORT1	Q99523	831 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	NRTN	Q99748	197 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	EPN3	Q9H201	632 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	ICK	Q9UPZ9	632 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CD4-208	ENST00000538827	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	CER1	O95813	267 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	SYP	P08247	313 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	DRD4	P21917	467 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	CCT8	P50990	548 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	CCNG1	P51959	295 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	LIMK1	P53667	647 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	NAA20	P61599	178 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	LCP2	Q13094	533 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	HLA-B	Q31612	363 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	CUZD1	Q86UP6	607 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	KY	Q8NBH2	561 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	OR56A3	Q8NH54	315 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CD4-208	ENST00000538827	TRMO	Q9BU70	441 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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