RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 USP25Q9UHP3 1055 aa2.9□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 CD84Q9UIB8 345 aa2.9□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ADAM21Q9UKJ8 722 aa2.9□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa2.9□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 SIK3Q9Y2K2 1263 aa2.9□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 CUBNO60494 3623 aa2.9□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 GAGE12BA1L429 117 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 GAGE12HA6NDE8 117 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 TRIM49BA6NDI0 452 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 C21orf140B9A014 251 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 DIRC3C9JPN6 131 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 J3KR12 359 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 GRID2O43424 1007 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 LDB2O43679 373 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 KDELR3O43731 214 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 CALUO43852 315 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 UNC5CO95185 931 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 F10P00742 488 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 C9P02748 559 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 S100BP04271 92 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 IVLP07476 585 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 PAEPP09466 180 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ELFN1P0C7U0 828 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 KRT5P13647 590 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 KELP23276 732 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 MST1P26927 711 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 PBX1P40424 430 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 FASLGP48023 281 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 GZMKP49863 264 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 SULT1E1P49888 294 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 VAV2P52735 878 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 SEC24CP53992 1094 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 WNT3AP56704 352 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 KRTAP10-11P60412 298 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 IL2P60568 153 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 CDK3Q00526 305 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 NHLH2Q02577 135 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 DEUP1Q05D60 604 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 CD69Q07108 199 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ELP6Q0PNE2 266 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 CDC16Q13042 620 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 PDCLQ13371 301 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 RAPGEF1Q13905 1077 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF235Q14590 738 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 IL11RAQ14626 422 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 C3AR1Q16581 482 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 AFMIDQ63HM1 303 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 IRGCQ6NXR0 463 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ERAP2Q6P179 960 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 GJB7Q6PEY0 223 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 IGFL3Q6UXB1 125 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 TSPAN33Q86UF1 283 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ZSCAN30Q86W11 494 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 NLRP14Q86W24 1093 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 FAM131BQ86XD5 332 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 PPP1R3BQ86XI6 285 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF354CQ86Y25 554 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ZZZ3Q8IYH5 903 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 PYROXD2Q8N2H3 581 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 GALNT16Q8N428 558 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ZADH2Q8N4Q0 377 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 TTC39CQ8N584 583 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 LINC00301Q8NCQ3 95 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 PIK3C3Q8NEB9 887 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 OR52N2Q8NGI0 321 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 LMO3Q8TAP4 145 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 TMEM174Q8WUU8 243 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 CHTF18Q8WVB6 975 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF606Q8WXB4 792 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 SHC3Q92529 594 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 RSC1A1Q92681 617 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 SCAMP4Q969E2 229 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ARSGQ96EG1 525 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 C1orf74Q96LT6 269 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 COQ10AQ96MF6 247 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 OR2M4Q96R27 311 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 NPY6RQ99463 290 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 NRTNQ99748 197 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 MESP1Q9BRJ9 268 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ZYG11BQ9C0D3 744 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ABCG8Q9H221 673 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 POFUT1Q9H488 388 aa2.89□□□□□ -1.95
CHMP4A-208ENST00000534106 ARFGAP3Q9NP61 516 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms